超声经颅多普勒血流分析仪过去应用的超声发射平吕一般为5~10MHZ，由于超声特性，其发射的频率越高，穿透力越低，只能反映浅表的血流情况，如四肢的周围血管血流测定，即使目前使用的3.5MHZ频率，能检测腹部、胸腔内脏器及其血流，但也受骨质的吸收的影响，遇到骨组织即发生严重衰减。

因此，要达到颅内深层组织，必须使用低频率的超声发射，检测深部血管血流变化，减少颅骨对超声的吸收。